En La Parguera existen varias asociaciones de plantas entre las que se encuentran: bosque estacional semi-siempre-verde, bosque caducifolio, matorral espinoso, pastizales, arboleda del litoral, salinas o marismas, manglares y praderas submarinas. En una región tan pequeña podemos encontrar gran diversidad de vegetación que hace de este lugar un sitio de belleza única para el disfrute de todos. Estudiemos en algún detalle cada uno de éstos tipos de vegetación:
****Bosque Estacional Semi-Siempre-Verde****
Este tipo de vegetación se encuentra en lugares dotados de agua y de suelos relativamente profundos, tales como: bordes de quebradas, cañadas y arroyos. La especie dominante es el húcar, pero muchas de las especies asociadas son siempre verdes. Además, podemos encontrar especies tales como: roble, guayacán, uvilla y violeta; que es una especie indígena de Puerto Rico y está en peligro de extinción.
****Bosque Caducifolio****
Este tipo de bosque se encuentra en las laderas de las colinas de moderada exposición al sol y al viento, en áreas de suelo fino o superficie rocosa. En este lugar predominan especies que en su mayoría permanecen sin hojas durante la época de sequía. Especies típicas de la asociación incluyen: almácigo, palo de vaca, tea, tachuelo y rolón o uña de gato, cuyos frutos son alimento para la mariquita. La altura y composición del bosque varían según el grado de exposición al viento, al sol y a la capacidad de retención de agua del suelo.
****Matorral Espinoso****
Los matorrales espinosos se encuentran en lugares más expuestos al sol, el viento y en áreas rocosas o de suelo extremadamente fino. Dicha vegetación será severamente afectada por la escasez de agua, resultando en la fragilidad y la lenta recuperación del sistema. En este hábitat dominan especies espinosas, de hojas reducidas o sin hojas, de dosel muy abierto y tallos esparcidos. También se observa la presencia de numerosos cactus. Las especies comunes son el almácigo, alelí blanco y cactus tales como: sebucán, tuna, brava, petate y pitahaya.
****Arboleda del litoral****
Esta asociación se encuentra en terrenos arenosos o rocosos a lo largo de la costa. La vegetación de esta zona está adaptada al salitre. En esta región podemos encontrar las siguientes especies típicas: la uva de playa, el mangle botón, el abeyuelo, la majaguilla, la zarcilla, tuna brava y otras plantas menos conocidas.
****Marismas o Salitrales****
Son áreas extensas de limo o arena que tienen concentraciones extremadamente altas en sales rastreras tales como varilla o planta de sal, verdolaga rosada, hierba de vidrio y hierba de sal. En lugares que no han sufrido la intervención del hombre podemos encontrar hacia tierra firme una zona de gramíneas y juncos, donde los terrenos son de menor salinidad. La parte ubicada hacia el manglar presenta un bosque achaparrado de mangle negro. En el pasado estos terrenos fueron utilizados para la industria de producción de sal. Estos suelos sirven de albergue a aves playeras migratorias, camarones y pequeños crustáceos.
****Manglar****
Un manglar es una agrupación de árboles que poseen ciertas adaptaciones que les permiten sobrevivir y desarrollarse en suelos anegados (terrenos inundados) que están sujetos a intrusiones de agua salada o salobre. La Parguera posee uno de los manglares más extensos de nuestra isla. En esta región se observan cuatro tipos de manglares. Los más abundantes son los islotes de mangle y el manglar de borde que crece en la orilla. El tipo de árbol dominante es el mangle rojo que se encuentra en contacto directo con el mar. Los manglares son recursos naturales importantes porque son ecosistemas de gran productividad debido a su alta materia orgánica; sirven como habitáculos para las aves y otros organismos marinos; son criaderos para muchas especies; y nos protegen contra la erosión y la costa en época de huracanes. Los manglares de La Parguera se utilizan para la recreación pasiva, los deportes acuáticos y actividades turísticas.
****Praderas Submarinas****
Estas se encuentran localizadas en los fondos marinos de aguas llanas, de baja incidencia de oleaje y de gran irradiación solar. Estos ecosistemas marinos son sumamente productivos. Están bien desarrollados y ocupan su mayor extensión en esta región. La hierba de tortuga es la que predomina en el área, seguida por la hierba de manatí. En La Parguera, la hierba de tortuga crece sobre piedra de coral, arena y cieno.
Las praderas submarinas poseen un tremendo valor ecológico porque: ofrecen albergue y alimento a gran variedad de organismos (carrucho, carey de concha, peces, manatíes y otros), sirven como criaderos, actúan como trampa de sedimentos y suplen gran cantidad de detrito (materia orgánica) a otros sistemas marinos.